20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1884 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1884  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
461 aa  881    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.778775  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2670  major facilitator superfamily MFS_1  60.17 
 
 
457 aa  535  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3167  major facilitator superfamily MFS_1  61.78 
 
 
462 aa  526  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1914  major facilitator superfamily MFS_1  61.44 
 
 
458 aa  513  1e-144  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.42815  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3781  major facilitator superfamily MFS_1  56.32 
 
 
449 aa  494  9.999999999999999e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2172  hypothetical protein  28.3 
 
 
401 aa  160  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00734692  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0322  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 
394 aa  147  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2949  major facilitator transporter  31.28 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163593  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  23.57 
 
 
406 aa  60.1  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  19.96 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  24.94 
 
 
386 aa  55.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  30.17 
 
 
387 aa  47  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  31.37 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  31.37 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  31.37 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0717  major facilitator superfamily MFS_1  22.43 
 
 
402 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.181007  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  22.75 
 
 
399 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  25 
 
 
418 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
398 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  43.08 
 
 
425 aa  43.1  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>