21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0050 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0050  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.259835 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0011  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0580345  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0048  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0042  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.835093  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0048  tRNA-Glu  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.200275 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0043  tRNA-Glu  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0019  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0046  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0017  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.253247  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 		 1563 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0040  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0023  tRNA-Lys  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0058  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0019  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0034  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0007  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0042  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.81664 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0016  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0030  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0016  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0045  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.556682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>