14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3118 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3118  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 226 aa  448  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4276  DNA polymerase beta domain protein region  75.22 
 
 		 261 aa  346  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1495  DNA polymerase beta domain protein region  41.51 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2550  DNA polymerase beta domain protein region  35.44 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0464694 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2688  DNA polymerase beta domain protein region  36.84 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.373799  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0234  DNA polymerase beta domain protein region  31.73 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.126142  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  40.96 
 
 		 121 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1533  catalase/peroxidase HPI  32.03 
 
 		 743 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07370  birA, biotin-(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  32.22 
 
 		 332 aa  44.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000566616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3208  catalase/peroxidase HPI  27.91 
 
 		 747 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3451  catalase/peroxidase HPI  28.48 
 
 		 748 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0362  DNA polymerase beta subunit  23.91 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0619  catalase/peroxidase HPI  28.22 
 
 		 756 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01773  catylase/peroxidase  27.91 
 
 		 726 aa  42  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>