30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0346 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0346  protein of unknown function DUF95 transmembrane  100 
 
 
528 aa  1010    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.160239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3166  protein of unknown function DUF95 transmembrane  47.6 
 
 
509 aa  371  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1427  protein of unknown function DUF95 transmembrane  44.72 
 
 
511 aa  351  2e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1138  hypothetical protein  33.76 
 
 
189 aa  69.7  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0410  hypothetical protein  35.88 
 
 
342 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65934  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1962  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.923141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3801  hypothetical protein  38.02 
 
 
322 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2368  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.97 
 
 
211 aa  53.5  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0527  hypothetical protein  28.37 
 
 
175 aa  53.9  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.917829  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0209  hypothetical protein  31.43 
 
 
176 aa  53.5  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0691804  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2502  putative integral membrane protein  28.44 
 
 
331 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4811  hypothetical protein  34.56 
 
 
321 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00997057  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  28.87 
 
 
337 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3829  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.52 
 
 
332 aa  51.6  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157843  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1030  hypothetical protein  33.6 
 
 
215 aa  50.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2278  protein of unknown function DUF95 transmembrane  36.64 
 
 
320 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1639  hypothetical protein  34.29 
 
 
193 aa  50.1  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5852  hypothetical protein  32.79 
 
 
336 aa  50.4  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2338  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.26 
 
 
329 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00579329  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2043  hypothetical protein  32.54 
 
 
188 aa  47.4  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_996  hypothetical protein  33.65 
 
 
185 aa  47  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0289  integral membrane protein  39 
 
 
246 aa  47  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271645  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0144  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.73 
 
 
329 aa  47  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1756  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.94 
 
 
197 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000547169  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3215  protein of unknown function DUF95 transmembrane  34.21 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0604768  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1023  hypothetical protein  35.78 
 
 
198 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0946  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.85 
 
 
188 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.886954  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0756  hypothetical protein  29.92 
 
 
336 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495478  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4823  protein of unknown function DUF95 transmembrane  24.89 
 
 
331 aa  45.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1213  hypothetical protein  31.09 
 
 
185 aa  44.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00201716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>