25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1451 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1451  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  840    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.92705  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5597  transposase IS3/IS911 family protein  45.9 
 
 
111 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4007  transposase IS3/IS911 family protein  45.9 
 
 
111 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9415  transposase IS3/IS911 family protein  52.5 
 
 
95 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4704  transposase IS3/IS911 family protein  52.5 
 
 
95 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4688  transposase IS3/IS911 family protein  52.5 
 
 
95 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  0.571862 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7354  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
105 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124441 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3165  transposase IS3/IS911 family protein  41.27 
 
 
105 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.897924  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3994  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 
111 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3354  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
107 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548623  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4117  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
107 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3188  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
107 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2401  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
107 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0789235  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2397  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
107 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0709  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
107 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0705  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
107 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640012  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0703  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
107 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0692  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
107 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0520  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
107 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0513  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
107 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  26.24 
 
 
1087 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
716 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0617  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 
106 aa  45.8  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.599694  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3633  transposase IS3/IS911 family protein  36.51 
 
 
112 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996449  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 
1082 aa  43.1  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>