14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1321 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1321  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  433  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1392  hypothetical protein  51.38 
 
 
202 aa  176  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113006  normal  0.353972 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0139  hypothetical protein  39.55 
 
 
220 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.355206 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2253  hypothetical protein  42.15 
 
 
197 aa  91.3  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.266247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1274  hypothetical protein  41.67 
 
 
201 aa  84.7  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0197804  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3546  hypothetical protein  31.75 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0041915  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2657  hypothetical protein  33.16 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24661  hypothetical protein  34.38 
 
 
1063 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0035  hypothetical protein  33.96 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2085  hypothetical protein  31.82 
 
 
959 aa  57  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.85609  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1302  hypothetical protein  33.81 
 
 
210 aa  55.5  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  28.42 
 
 
497 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  27.87 
 
 
491 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0259  hypothetical protein  31.17 
 
 
928 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>