44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1123 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1123  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  299  7.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1038  hypothetical protein  53.51 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4343 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2572  hypothetical protein  53.04 
 
 
126 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0278  protein of unknown function DUF123  52.25 
 
 
125 aa  120  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0991873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02280  hypothetical protein  33.58 
 
 
138 aa  87  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0578  protein of unknown function DUF123  31.67 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0479  protein of unknown function DUF123  35.71 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0625  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0654  protein of unknown function DUF123  40.43 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1807  hypothetical protein  40.82 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796576  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0198  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000406548  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1312  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.474029 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0507  hypothetical protein  32.8 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.9 
 
 
357 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.21 
 
 
356 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.72 
 
 
356 aa  62  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.75 
 
 
356 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0858  hypothetical protein  41.24 
 
 
165 aa  61.2  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  36.13 
 
 
356 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0747  hypothetical protein  34.51 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0646  hypothetical protein  35.9 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.269467  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2461  hypothetical protein  37.6 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0042  hypothetical protein  38.02 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.899596  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0396  endonuclease III  32.39 
 
 
174 aa  54.7  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0815  hypothetical protein  32.69 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2695  hypothetical protein  34.4 
 
 
188 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0067  hypothetical protein  42.22 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1232  hypothetical protein  34.15 
 
 
164 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0414  protein of unknown function DUF123  38.02 
 
 
144 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3380  protein of unknown function DUF123  35.9 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0898  protein of unknown function DUF123  34.4 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0253075  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1462  protein of unknown function DUF123  34.19 
 
 
142 aa  50.4  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0051  hypothetical protein  37.88 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0776  protein of unknown function DUF123  41.3 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3196  protein of unknown function DUF123  35.04 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1958  hypothetical protein  36.59 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0871  hypothetical protein  38.67 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0265  hypothetical protein  28.71 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0984626  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1962  hypothetical protein  33.77 
 
 
119 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1424  hypothetical protein  26.6 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149794  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0937  protein of unknown function DUF123  32.94 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.305351  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1482  hypothetical protein  33.71 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0956236  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0267  hypothetical protein  26.73 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0194677  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0792  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0013461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>