45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0706 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  100 
 
 		 125 aa  241  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0519  putative transmembrane protein  50.85 
 
 		 137 aa  98.2  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.978517 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1557  hypothetical protein  35.29 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1666  hypothetical protein  35.77 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.361842  hitchhiker  0.00498054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4967  membrane protein-like protein  39.6 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  37.39 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2778  hypothetical protein  34.19 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1996  putative transmembrane protein  37.61 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1118  membrane protein-like protein  40 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1199  membrane protein-like protein  40 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.553066  normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1747  hypothetical protein  38.82 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  33.65 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3192  hypothetical protein  30.97 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0660225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  35.85 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1129  hypothetical protein  30.84 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00728064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2990  membrane protein-like  34.62 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0557  Protein of unknown function DUF2069, membrane  34.88 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  33.04 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4599  membrane protein  38.46 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  0.568501 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03196  hypothetical protein  37.7 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002785  hypothetical protein  37.7 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2248  putative transmembrane protein  33.7 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  37.5 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3070  transmembrane protein  32.04 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  hitchhiker  0.000683085 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  32.11 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0866  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.060146  normal  0.425014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1453  membrane protein-like  38.46 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0981  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4561  hypothetical protein  36.21 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.672359  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2770  membrane protein-like protein  30.51 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0344559 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1839  hypothetical protein  30.63 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52000  hypothetical protein  35.34 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139093 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2775  hypothetical protein  35.05 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1335  membrane protein-like protein  36.89 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1248  transmembrane protein  36.54 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1518  putative transmembrane protein  31.37 
 
 		 124 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107049 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2486  hypothetical protein  28.85 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1753  hypothetical protein  32.84 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.819388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1825  hypothetical protein  25.6 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0194222  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1788  hypothetical protein  25.6 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0972  membrane protein  37.36 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269392  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2497  hypothetical protein  25.6 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.404496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1454  membrane protein  37.36 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1432  membrane protein  37.36 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2991  membrane protein-like protein  34.91 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>