18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0253 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0253  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
86 aa  169  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1036  phosphopantetheine-binding  43.42 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121028  normal  0.393092 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0931  hypothetical protein  42.67 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2709  phosphopantetheine-binding  34.62 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169236  hitchhiker  0.0000263676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1612  hypothetical protein  35.14 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00005517  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0384  phosphopantetheine-binding  40.62 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3572  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.141055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4648  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1111  phosphopantetheine-binding protein  30.38 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0507  phosphopantetheine-binding  35.06 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1122  phosphopantetheine-binding protein  30.38 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2594  phosphopantetheine-binding  37.33 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79488  hitchhiker  0.000628646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3287  phosphopantetheine-binding  29.33 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1094  phosphopantetheine-binding protein  30.38 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1416  hypothetical protein  41.54 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0765  phosphopantetheine-binding  34.67 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321905  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7032  hypothetical protein  41.27 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343078  normal  0.583052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1411  phosphopantetheine-binding protein  32.47 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>