38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1080 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1080  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  436  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3632  hypothetical protein  38.14 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1271  hypothetical protein  39.25 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00860281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0440  hypothetical protein  39.25 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000354485  hitchhiker  0.00000494731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1163  hypothetical protein  39.25 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000035271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3042  hypothetical protein  37.32 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2760  protein of unknown function DUF1007  35.15 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1233  protein of unknown function DUF1007  37.5 
 
 		 202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3032  hypothetical protein  33.01 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.199492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1095  protein of unknown function DUF1007  36.04 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2707  hypothetical protein  32.37 
 
 		 212 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874677  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2814  hypothetical protein  32.37 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2752  hypothetical protein  32.37 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2927  hypothetical protein  32.37 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2793  hypothetical protein  32.37 
 
 		 209 aa  131  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1975  putative lipoprotein  27.91 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0675  protein of unknown function DUF1007  26.73 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.019732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2975  protein of unknown function DUF1007  22.73 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0089  hypothetical protein  27.6 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0097  hypothetical protein  27.6 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2246  hypothetical protein  22.84 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4248  hypothetical protein  27.01 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3809  hypothetical protein  23.11 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2375  protein of unknown function DUF1007  23.62 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18361 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2774  hypothetical protein  26.39 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0082  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2712  hypothetical protein  24.06 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3209  hypothetical protein  21.21 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  24.57 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3392  protein of unknown function DUF1007  24.65 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2906  hypothetical protein  23.87 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0941  protein of unknown function DUF1007  21.7 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049615  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4544  hypothetical protein  23.62 
 
 		 217 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25009  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  20.09 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1679  protein of unknown function DUF1007  20.09 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355728  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0859  hypothetical protein  20.18 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4269  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  17.61 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.655735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1738  hypothetical protein  20.85 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0927626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>