30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3956 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3956  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2500  hypothetical protein  71.43 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00388461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  70.67 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0192  hypothetical protein  51.39 
 
 		 80 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.77367  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  43.48 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  50.7 
 
 		 85 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0568  hypothetical protein  44.29 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2376  hypothetical protein  47.95 
 
 		 80 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1246  hypothetical protein  43.48 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1329  Protein of unknown function DUF2442  47.14 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0492  hypothetical protein  44.62 
 
 		 97 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1439  hypothetical protein  40.58 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.766966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1018  hypothetical protein  37.68 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  35 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2429  hypothetical protein  37.97 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  39.66 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1569  hypothetical protein  38.24 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.997179  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1342  hypothetical protein  34.29 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1387  hypothetical protein  34.29 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0240  hypothetical protein  38.71 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  38.36 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1650  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  31.88 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1000  hypothetical protein  52.78 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130432  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4194  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2540  hypothetical protein  28.77 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  36.11 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1097  hypothetical protein  30 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1900  hypothetical protein  35.48 
 
 		 101 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.030985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5000  hypothetical protein  32.26 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>