12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2731 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2731  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  261  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1887  hypothetical protein  48.18 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000765613  hitchhiker  0.00000000121292 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1000  hypothetical protein  42.11 
 
 		 218 aa  83.6  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000422798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1806  hypothetical protein  34.04 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1598  YbbR family protein  33.88 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2636  hypothetical protein  33.62 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0277  YbbR-like protein  28.43 
 
 		 224 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.322276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  30.25 
 
 		 316 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3455  hypothetical protein  27.1 
 
 		 483 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000996769 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1367  hypothetical protein  25 
 
 		 470 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.010131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1516  hypothetical protein  20 
 
 		 300 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.474262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2255  hypothetical protein  29.46 
 
 		 142 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>