17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2726 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2726  addiction module component  100 
 
 
88 aa  180  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1323  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000192785  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0583  hypothetical protein  48.53 
 
 
78 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149229  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2340  addiction module component, TIGR02574 family  45.45 
 
 
74 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1706  hypothetical protein  46.03 
 
 
68 aa  61.6  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1551  hypothetical protein  51.61 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2257  hypothetical protein  44.62 
 
 
117 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746631  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1129  hypothetical protein  40 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0353  addiction module component  36.51 
 
 
72 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0133  addiction module component, TIGR02574 family  35.71 
 
 
71 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0713  hypothetical protein  39.39 
 
 
77 aa  50.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.03321 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4020  hypothetical protein  33.82 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0591  addiction module component, TIGR02574 family  36.51 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0253  addiction module component  34.29 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.372045  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1114  addiction module component, TIGR02574 family  35.71 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0280  addiction module component, TIGR02574 family  32.84 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0331171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1103  addiction module component  36.36 
 
 
73 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>