15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1373 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1373  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  585  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000882706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1606  hypothetical protein  59.58 
 
 
287 aa  346  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000014118  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1618  hypothetical protein  57.99 
 
 
287 aa  332  5e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2742  CheC domain protein  51.04 
 
 
288 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00482165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  28.47 
 
 
154 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4081  heat shock protein DnaJ-like  30 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.05144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4205  heat shock protein DnaJ domain protein  30 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4230  heat shock protein DnaJ domain protein  29.41 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0473127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0079  hypothetical protein  29.63 
 
 
256 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.990933  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2756  hypothetical protein  24.17 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  25 
 
 
1141 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0771  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.42 
 
 
245 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  25.89 
 
 
340 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2024  protein-tyrosine kinase  32.58 
 
 
298 aa  43.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.607078  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2917  hypothetical protein  27.52 
 
 
244 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>