36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0240 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0240  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1477  hypothetical protein  56.76 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2429  hypothetical protein  45.71 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  40.28 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  35.44 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1211  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  32.5 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56263  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  30.49 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2500  hypothetical protein  34.78 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00388461  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  40.32 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  35.44 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  32.26 
 
 
90 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1066  hypothetical protein  31.33 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3956  hypothetical protein  38.71 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1000  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130432  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5000  hypothetical protein  33.33 
 
 
74 aa  51.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0662  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.6245  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0654  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.169854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00619  hypothetical protein  32.93 
 
 
86 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2540  hypothetical protein  34.48 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0492  hypothetical protein  34.72 
 
 
97 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29977  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1569  hypothetical protein  36.36 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.997179  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4194  hypothetical protein  28.77 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0192  hypothetical protein  31.25 
 
 
80 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.77367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1993  hypothetical protein  34.72 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0558528  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0896  hypothetical protein  33.78 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89715  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0568  hypothetical protein  30.26 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1134  hypothetical protein  32.05 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.372045  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  33.33 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3398  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  27.91 
 
 
89 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1142  hypothetical protein  33.33 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0674  hypothetical protein  27.4 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1387  hypothetical protein  31.75 
 
 
80 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  33.78 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1342  hypothetical protein  31.75 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1900  hypothetical protein  38.1 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.030985 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1819  hypothetical protein  30.67 
 
 
118 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>