More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3358 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3358  Leucyl aminopeptidase  100 
 
 
502 aa  972    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  53.33 
 
 
507 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3073  Leucyl aminopeptidase  54.98 
 
 
515 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10530  leucyl aminopeptidase  54.27 
 
 
498 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46137  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1354  Leucyl aminopeptidase  54.36 
 
 
499 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3321  leucyl aminopeptidase  52.71 
 
 
513 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.177595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3310  leucyl aminopeptidase  52.71 
 
 
513 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3372  leucyl aminopeptidase  52.71 
 
 
513 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.183674 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12241  leucyl aminopeptidase  54.39 
 
 
515 aa  436  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.299314 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  51.21 
 
 
490 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3575  leucyl aminopeptidase  50.68 
 
 
510 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00437007  normal  0.0600752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1271  leucyl aminopeptidase  51.25 
 
 
502 aa  431  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.609468  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2938  leucyl aminopeptidase  52.52 
 
 
505 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1518  Leucyl aminopeptidase  51.63 
 
 
505 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222641  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1613  leucyl aminopeptidase  47.06 
 
 
508 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000981229  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1607  Leucyl aminopeptidase  48.44 
 
 
507 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000366671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3091  Leucyl aminopeptidase  52.07 
 
 
545 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00268238  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13310  leucyl aminopeptidase  50.68 
 
 
510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0623814  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3133  leucyl aminopeptidase  52.07 
 
 
531 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.100377  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3549  leucyl aminopeptidase  53.59 
 
 
521 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.984624  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4388  Leucyl aminopeptidase  51.69 
 
 
490 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1781  leucyl aminopeptidase  51.52 
 
 
537 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228538  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15490  leucyl aminopeptidase  51.95 
 
 
493 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0945  Leucyl aminopeptidase  51.42 
 
 
495 aa  382  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.593268  normal  0.199741 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2029  Leucyl aminopeptidase  50.92 
 
 
499 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0427313  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0995  leucyl aminopeptidase  51.3 
 
 
499 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.842582  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3317  leucyl aminopeptidase  51.74 
 
 
521 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614561  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2306  leucyl aminopeptidase  48.47 
 
 
497 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.942842  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1834  leucyl aminopeptidase  49 
 
 
506 aa  359  6e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1874  Leucyl aminopeptidase  50.4 
 
 
497 aa  348  1e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219143  normal  0.0871837 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2098  Leucyl aminopeptidase  50.7 
 
 
499 aa  347  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.827384  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0937  leucyl aminopeptidase  46.44 
 
 
537 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.104658  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1867  Leucyl aminopeptidase  56.42 
 
 
505 aa  339  8e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00187713  decreased coverage  0.000509226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3276  Leucyl aminopeptidase  55.64 
 
 
499 aa  335  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187039  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16420  leucyl aminopeptidase  45.83 
 
 
492 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16320  leucyl aminopeptidase  42.11 
 
 
524 aa  310  5e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.197176  normal  0.502851 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0038  leucyl aminopeptidase  37.13 
 
 
504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  44.12 
 
 
482 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  41.4 
 
 
501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  45.99 
 
 
488 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  36.12 
 
 
511 aa  279  7e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  39.06 
 
 
492 aa  279  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0328  leucyl aminopeptidase  46.4 
 
 
530 aa  276  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0360646  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0566  leucyl aminopeptidase  42.82 
 
 
478 aa  275  2.0000000000000002e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  44.92 
 
 
487 aa  274  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1364  Leucyl aminopeptidase  37.08 
 
 
492 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  40.28 
 
 
491 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0837  Leucyl aminopeptidase  37.68 
 
 
483 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.775484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4097  leucyl aminopeptidase  45.33 
 
 
518 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128156  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0849  Leucyl aminopeptidase  40.36 
 
 
491 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.531813  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  37.92 
 
 
497 aa  268  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0008  Leucyl aminopeptidase  44.62 
 
 
502 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  39.56 
 
 
496 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0880  leucyl aminopeptidase  43.13 
 
 
616 aa  267  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4247  Leucyl aminopeptidase  45.36 
 
 
518 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0903  leucyl aminopeptidase  34.07 
 
 
495 aa  266  8.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1030  cytosol aminopeptidase family protein  36.12 
 
 
495 aa  265  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.414121  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17591  leucyl aminopeptidase  34.07 
 
 
495 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  42.67 
 
 
497 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  42.4 
 
 
497 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  42.4 
 
 
497 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4222  Leucyl aminopeptidase  44.83 
 
 
518 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.345657  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  42.86 
 
 
496 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_901  cytosol aminopeptidase/leucyl aminopeptidase  35.89 
 
 
495 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0210903  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  41.87 
 
 
497 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  39.74 
 
 
496 aa  260  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  36.23 
 
 
496 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  43.62 
 
 
512 aa  259  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0913  leucyl aminopeptidase  35.89 
 
 
497 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00605227  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0500  Leucyl aminopeptidase  41.44 
 
 
474 aa  258  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000407784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  42.58 
 
 
496 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4642  Leucyl aminopeptidase  41.21 
 
 
480 aa  256  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1606  leucyl aminopeptidase  38.52 
 
 
483 aa  256  8e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0147081  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  39.25 
 
 
492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06390  leucyl aminopeptidase  44.99 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  41.51 
 
 
496 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2121  Leucyl aminopeptidase  45.54 
 
 
465 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  41.91 
 
 
528 aa  253  8.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0724  Leucyl aminopeptidase  46.39 
 
 
455 aa  252  1e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  36.83 
 
 
493 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  39.68 
 
 
497 aa  250  4e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  40.35 
 
 
495 aa  250  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  35.75 
 
 
488 aa  250  4e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  39.68 
 
 
497 aa  250  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  35.18 
 
 
500 aa  249  7e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  35.54 
 
 
498 aa  249  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  35.52 
 
 
518 aa  249  8e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  38.16 
 
 
503 aa  248  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3894  Leucyl aminopeptidase  39.92 
 
 
505 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04810  leucyl aminopeptidase  43.55 
 
 
512 aa  248  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.388112 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  39.43 
 
 
496 aa  247  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  37.25 
 
 
497 aa  247  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  36 
 
 
493 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  38.22 
 
 
495 aa  244  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3886  Leucyl aminopeptidase  38.05 
 
 
524 aa  243  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.384144  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3363  Leucyl aminopeptidase  38.37 
 
 
471 aa  243  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0789  Leucyl aminopeptidase  43.96 
 
 
455 aa  243  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  37.27 
 
 
510 aa  243  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  37.93 
 
 
495 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  42.68 
 
 
491 aa  242  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>