More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3133 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3133  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 531 aa  1021    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.100377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1781  leucyl aminopeptidase  67.47 
 
 		 537 aa  571  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228538  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  53.59 
 
 		 507 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3091  Leucyl aminopeptidase  56.24 
 
 		 545 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00268238  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1271  leucyl aminopeptidase  55.66 
 
 		 502 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.609468  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3358  Leucyl aminopeptidase  52.07 
 
 		 502 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1607  Leucyl aminopeptidase  50.1 
 
 		 507 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000366671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1613  leucyl aminopeptidase  49 
 
 		 508 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000981229  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3073  Leucyl aminopeptidase  49.68 
 
 		 515 aa  412  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10530  leucyl aminopeptidase  50.5 
 
 		 498 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46137  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  48.83 
 
 		 490 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0945  Leucyl aminopeptidase  53.53 
 
 		 495 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.593268  normal  0.199741 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0995  leucyl aminopeptidase  55.44 
 
 		 499 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.842582  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3549  leucyl aminopeptidase  52.05 
 
 		 521 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.984624  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1518  Leucyl aminopeptidase  47.6 
 
 		 505 aa  388  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222641  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1354  Leucyl aminopeptidase  50.31 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3321  leucyl aminopeptidase  47.87 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.177595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3310  leucyl aminopeptidase  47.87 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3372  leucyl aminopeptidase  47.87 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.183674 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13310  leucyl aminopeptidase  50.19 
 
 		 510 aa  381  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0623814  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3317  leucyl aminopeptidase  50.98 
 
 		 521 aa  378  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12241  leucyl aminopeptidase  46.83 
 
 		 515 aa  378  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.299314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1834  leucyl aminopeptidase  48.65 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4388  Leucyl aminopeptidase  48.87 
 
 		 490 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2306  leucyl aminopeptidase  48.8 
 
 		 497 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.942842  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2938  leucyl aminopeptidase  46.96 
 
 		 505 aa  368  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15490  leucyl aminopeptidase  53.56 
 
 		 493 aa  362  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3575  leucyl aminopeptidase  46.68 
 
 		 510 aa  361  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00437007  normal  0.0600752 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2098  Leucyl aminopeptidase  53.25 
 
 		 499 aa  356  5e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.827384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0937  leucyl aminopeptidase  50.57 
 
 		 537 aa  355  1e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.104658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3276  Leucyl aminopeptidase  59.58 
 
 		 499 aa  345  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187039  normal  0.0901394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2029  Leucyl aminopeptidase  48.58 
 
 		 499 aa  345  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0427313  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  42.89 
 
 		 492 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1874  Leucyl aminopeptidase  58.89 
 
 		 497 aa  333  6e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219143  normal  0.0871837 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16420  leucyl aminopeptidase  45.4 
 
 		 492 aa  330  5.0000000000000004e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  42.98 
 
 		 497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  43.66 
 
 		 491 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  39.88 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  40.37 
 
 		 497 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  39.52 
 
 		 496 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  41.68 
 
 		 496 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  38.37 
 
 		 496 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0328  leucyl aminopeptidase  46.41 
 
 		 530 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0360646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  39.31 
 
 		 496 aa  302  9e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0038  leucyl aminopeptidase  35.59 
 
 		 504 aa  300  6e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  41.41 
 
 		 487 aa  299  7e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  39.92 
 
 		 497 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  39.92 
 
 		 497 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  46.11 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  39.92 
 
 		 497 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  40.94 
 
 		 495 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  38.8 
 
 		 511 aa  297  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  38.73 
 
 		 512 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  37.96 
 
 		 518 aa  296  5e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  41.89 
 
 		 496 aa  291  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  40.04 
 
 		 496 aa  292  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  39.83 
 
 		 495 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  40.94 
 
 		 495 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4097  leucyl aminopeptidase  43.45 
 
 		 518 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.128156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  40.04 
 
 		 488 aa  289  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1030  cytosol aminopeptidase family protein  39.87 
 
 		 495 aa  288  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.414121  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  36.14 
 
 		 501 aa  287  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  38.38 
 
 		 496 aa  286  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  38.96 
 
 		 498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1867  Leucyl aminopeptidase  51.12 
 
 		 505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00187713  decreased coverage  0.000509226 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0837  Leucyl aminopeptidase  39.23 
 
 		 483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.775484  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16320  leucyl aminopeptidase  41.09 
 
 		 524 aa  285  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.197176  normal  0.502851 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  40.48 
 
 		 503 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4222  Leucyl aminopeptidase  44.74 
 
 		 518 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.345657  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_901  cytosol aminopeptidase/leucyl aminopeptidase  37.97 
 
 		 495 aa  282  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0210903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0628  leucyl aminopeptidase  44.06 
 
 		 496 aa  280  5e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.052928  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0913  leucyl aminopeptidase  38.99 
 
 		 497 aa  278  1e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00605227  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  35.89 
 
 		 506 aa  278  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0395  leucyl aminopeptidase  36.8 
 
 		 504 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4247  Leucyl aminopeptidase  45.1 
 
 		 518 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  41.09 
 
 		 496 aa  276  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  38.22 
 
 		 497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  36.45 
 
 		 503 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0566  leucyl aminopeptidase  41.55 
 
 		 478 aa  273  8.000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  41.44 
 
 		 500 aa  271  2e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0740  leucyl aminopeptidase  36.14 
 
 		 501 aa  271  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1124  leucyl aminopeptidase  40.97 
 
 		 485 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.67356  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3886  Leucyl aminopeptidase  39.46 
 
 		 524 aa  270  4e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.384144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  42.83 
 
 		 491 aa  270  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  39.1 
 
 		 497 aa  269  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  37.55 
 
 		 510 aa  269  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1364  Leucyl aminopeptidase  38.9 
 
 		 492 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  40.61 
 
 		 501 aa  268  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  41.53 
 
 		 528 aa  268  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1942  leucyl aminopeptidase  38.11 
 
 		 484 aa  268  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189087  normal  0.0962979 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0580  leucyl aminopeptidase  36.17 
 
 		 503 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458799  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0880  leucyl aminopeptidase  49.71 
 
 		 616 aa  267  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04810  leucyl aminopeptidase  46.51 
 
 		 512 aa  266  5e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.388112 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  37.21 
 
 		 497 aa  266  8e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0849  Leucyl aminopeptidase  40.69 
 
 		 491 aa  266  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.531813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  36.81 
 
 		 503 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  37.23 
 
 		 497 aa  265  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  35.79 
 
 		 503 aa  265  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  36.81 
 
 		 503 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  37.79 
 
 		 497 aa  265  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>