34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3229 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3229  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  398  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1443  hypothetical protein  47.09 
 
 		 211 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2927  hypothetical protein  42.86 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3408  hypothetical protein  43.88 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12830  conserved hypothetical protein TIGR03085  43.22 
 
 		 248 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213535  normal  0.0190582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2240  hypothetical protein  40.82 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.168407  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0292  hypothetical protein  39.11 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0452  hypothetical protein  41.41 
 
 		 205 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0463  hypothetical protein  41.41 
 
 		 205 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.78842 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0439  hypothetical protein  40.91 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.471698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0630  hypothetical protein  38.19 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5808  hypothetical protein  40.72 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2970  hypothetical protein  44.28 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0094971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3182  hypothetical protein  41.71 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.429032 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0865  hypothetical protein  43.84 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.642531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4607  hypothetical protein  37.06 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0303145  hitchhiker  0.0000208711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0267  hypothetical protein  35.75 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3035  hypothetical protein  38.58 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2192  hypothetical protein  40.1 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1677  hypothetical protein  37.77 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.47521e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1682  hypothetical protein  36.6 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.087821  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3980  hypothetical protein  41.87 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2229  hypothetical protein  39 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6520  hypothetical protein  35.62 
 
 		 240 aa  95.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.0543517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20820  conserved hypothetical protein TIGR03085  40.1 
 
 		 214 aa  94.7  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.395226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15570  conserved hypothetical protein TIGR03085  38.46 
 
 		 209 aa  92.4  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11958  hypothetical protein  42.23 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0608324  normal  0.971894 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1770  hypothetical protein  36.16 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92711  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10040  hypothetical protein  39.81 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305113  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  31.02 
 
 		 225 aa  84.7  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1996  hypothetical protein  36.04 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  32.52 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12073  hypothetical protein  30.83 
 
 		 213 aa  41.6  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>