16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2959 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2959    100 
 
 
425 bp  842    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  87.83 
 
 
1233 bp  226  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  87.83 
 
 
1233 bp  226  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  87.83 
 
 
1233 bp  226  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  87.83 
 
 
1233 bp  226  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0352    87.01 
 
 
1213 bp  204  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1573    82.82 
 
 
1271 bp  133  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0550  transposase, mutator type  82.17 
 
 
1233 bp  123  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0581  transposase, mutator type  82.17 
 
 
1233 bp  123  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0585  transposase, mutator type  82.17 
 
 
1233 bp  123  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390159  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  100 
 
 
1806 bp  52  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  89.13 
 
 
1260 bp  52  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  89.13 
 
 
1260 bp  52  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  89.13 
 
 
1260 bp  52  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  96.3 
 
 
1347 bp  46.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  96.3 
 
 
1167 bp  46.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>