27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2910 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2910    100 
 
 		 869 bp  1723    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216552  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3950    85.57 
 
 		 827 bp  81.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00444171  normal  0.0567836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  84.31 
 
 		 915 bp  75.8  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4352    86.42 
 
 		 447 bp  73.8  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4729    83.65 
 
 		 522 bp  71.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5037    97.22 
 
 		 875 bp  63.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  0.0357994 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4226  hypothetical protein  89.8 
 
 		 417 bp  58  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4190  hypothetical protein  89.8 
 
 		 417 bp  58  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6914    87.04 
 
 		 321 bp  52  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5834    87.04 
 
 		 468 bp  52  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1102  putative transposase  96.55 
 
 		 387 bp  50.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.334321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0584    93.94 
 
 		 898 bp  50.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3086  putative transposase  100 
 
 		 381 bp  50.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0482    93.94 
 
 		 898 bp  50.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0987444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3611    88.89 
 
 		 888 bp  50.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0496  transposase, IS4 family protein  93.94 
 
 		 555 bp  50.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0285  transposase, IS4 family protein  93.94 
 
 		 555 bp  50.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5549    93.94 
 
 		 898 bp  50.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3276  transposase  93.75 
 
 		 393 bp  48.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  96.43 
 
 		 567 bp  48.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2507  transposase  96.43 
 
 		 378 bp  48.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6645    85.71 
 
 		 144 bp  48.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  96.43 
 
 		 378 bp  48.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3940    85.71 
 
 		 228 bp  48.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114444  hitchhiker  0.00715873 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19860    91.67 
 
 		 384 bp  48.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.85437  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0539    88.64 
 
 		 144 bp  48.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3557  quinolinate synthetase  96.43 
 
 		 1293 bp  48.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00755021  normal  0.140147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>