22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2598 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2598    100 
 
 		 1184 bp  2347    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383932  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4393    80.72 
 
 		 1240 bp  153  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2502    80.72 
 
 		 1273 bp  153  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2537  transposase IS4 family protein  85.43 
 
 		 1239 bp  125  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000138999  hitchhiker  0.00019554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2535  transposase IS4 family protein  85.43 
 
 		 1239 bp  125  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011121  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1609  transposase IS4 family protein  85.43 
 
 		 1239 bp  125  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.200563  normal  0.245783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4190    87.2 
 
 		 435 bp  121  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2753  transposase  88 
 
 		 897 bp  103  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3175  transposase, IS4  87.76 
 
 		 141 bp  99.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4227  transposase, IS4  84.43 
 
 		 1299 bp  91.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1089  transposase, IS4  84.43 
 
 		 1173 bp  91.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6980    89.47 
 
 		 144 bp  87.7  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.270706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2794  transposase IS4 family protein  83.61 
 
 		 1257 bp  83.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1728  putative transposase  82.76 
 
 		 1299 bp  71.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.579187  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1763  putative transposase  82.76 
 
 		 1308 bp  71.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2752    85.48 
 
 		 588 bp  52  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0849813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4677  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  93.94 
 
 		 1779 bp  50.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0983724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6788    96.43 
 
 		 1313 bp  48.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617764  normal  0.368676 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5800  hypothetical protein  100 
 
 		 1311 bp  48.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000132526 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5628  hypothetical protein  100 
 
 		 1215 bp  48.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431962  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3076  transposase  91.67 
 
 		 1437 bp  48.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0424    85.71 
 
 		 1133 bp  48.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>