More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2216 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2216  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 		 474 aa  967    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3924  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  67.83 
 
 		 457 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  decreased coverage  0.00345047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1725  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.02 
 
 		 471 aa  600  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.450617  decreased coverage  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2797  Aldehyde Dehydrogenase  65.79 
 
 		 457 aa  590  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3843  succinic semialdehyde dehydrogenase  64.63 
 
 		 458 aa  578  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1956  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.27 
 
 		 457 aa  579  1e-164  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1742  succinic semialdehyde dehydrogenase  61.49 
 
 		 470 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10236  succinic semialdehyde dehydrogenase  63 
 
 		 511 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  57.73 
 
 		 465 aa  527  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.909574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0377  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  55.92 
 
 		 454 aa  519  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2737  Aldehyde Dehydrogenase  55.48 
 
 		 454 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4169  Aldehyde Dehydrogenase  56.46 
 
 		 455 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1926  aldehyde dehydrogenase  54.92 
 
 		 455 aa  499  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.515635  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4209  Aldehyde Dehydrogenase  56.46 
 
 		 455 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0839  aldehyde Dehydrogenase  53.49 
 
 		 455 aa  490  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2711  Aldehyde Dehydrogenase  52.89 
 
 		 464 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.275428  hitchhiker  0.000000324245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3534  aldehyde dehydrogenase  53.71 
 
 		 455 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.46589 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3003  aldehyde dehydrogenase  55.73 
 
 		 469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000280927  normal  0.841466 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3223  Aldehyde Dehydrogenase  53.42 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.989475  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1074  putative aldehyde dehydrogenase  50.88 
 
 		 454 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000640606  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3122  Aldehyde Dehydrogenase_  52.88 
 
 		 469 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3025  aldehyde dehydrogenase  53.76 
 
 		 469 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  50 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1159  Aldehyde Dehydrogenase  49.12 
 
 		 466 aa  435  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1887  aldehyde dehydrogenase  48.03 
 
 		 456 aa  429  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2008  Aldehyde Dehydrogenase  49.34 
 
 		 465 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6328  Aldehyde Dehydrogenase  48.28 
 
 		 460 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0373532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4408  Aldehyde Dehydrogenase  46.7 
 
 		 457 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2100  Aldehyde Dehydrogenase  46.52 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.773732  normal  0.123203 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  47.15 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2448  aldehyde dehydrogenase  48.14 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  45.15 
 
 		 449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  45.59 
 
 		 455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3617  Aldehyde Dehydrogenase  47.71 
 
 		 470 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2318  Aldehyde Dehydrogenase  45.37 
 
 		 452 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1346  Aldehyde Dehydrogenase  46.71 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.211595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1120  aldehyde dehydrogenase  46.98 
 
 		 485 aa  396  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000801479 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1825  Aldehyde Dehydrogenase  46 
 
 		 461 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3151  aldehyde dehydrogenase family protein  43.81 
 
 		 461 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2542  aldehyde dehydrogenase  42.67 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2894  aldehyde dehydrogenase  43.58 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2704  aldehyde dehydrogenase  43.58 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598513 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1188  aldehyde dehydrogenase  48.7 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417271  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4194  Aldehyde Dehydrogenase  44.62 
 
 		 487 aa  392  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1620  aldehyde dehydrogenase  42.23 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3276  aldehyde dehydrogenase  43.58 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0875007 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2453  Aldehyde Dehydrogenase  49.67 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0352  aldehyde dehydrogenase  44.49 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.491139  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1858  Aldehyde Dehydrogenase  45.1 
 
 		 457 aa  391  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4057  Aldehyde Dehydrogenase  44.08 
 
 		 457 aa  391  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  44.52 
 
 		 526 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0333  Aldehyde Dehydrogenase  48.57 
 
 		 452 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.909996  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  41.85 
 
 		 452 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2660  aldehyde dehydrogenase family protein  44.35 
 
 		 463 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349181  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1292  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+]  42.79 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1541  hypothetical protein  41.87 
 
 		 462 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1442  hypothetical protein  41.87 
 
 		 462 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2363  putative aldehyde dehydrogenase  44.93 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.97252  normal  0.760818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2394  aldehyde dehydrogenase  44.12 
 
 		 463 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0666523  normal  0.869122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2563  aldehyde dehydrogenase  43.36 
 
 		 461 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2399  Aldehyde Dehydrogenase  43.89 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0222  aldehyde dehydrogenase  42.42 
 
 		 456 aa  378  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0523  putative aldehyde dehydrogenase  43.83 
 
 		 460 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2056  Aldehyde Dehydrogenase  42.58 
 
 		 457 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0352  aldehyde dehydrogenase family protein  43.01 
 
 		 457 aa  372  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000509141  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15470  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  44.88 
 
 		 458 aa  369  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.580059  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0508  aldehyde dehydrogenase  42.23 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1989  aldehyde dehydrogenase family protein  40.71 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2070  aldehyde dehydrogenase  43.64 
 
 		 475 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0905776  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2457  aldehyde dehydrogenase  40.75 
 
 		 463 aa  365  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4778  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.67 
 
 		 456 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1124  aldehyde dehydrogenase family protein  41.01 
 
 		 458 aa  364  2e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.115238  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2946  aldehyde dehydrogenase  42.07 
 
 		 463 aa  364  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03968  succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.7 
 
 		 462 aa  364  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3357  aldehyde dehydrogenase  42.07 
 
 		 463 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1911  aldehyde dehydrogenase  39.34 
 
 		 458 aa  363  3e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1608  aldehyde dehydrogenase  42.76 
 
 		 443 aa  363  3e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00454  aldehyde-dehydrogenase like protein YneI  44.98 
 
 		 454 aa  362  9e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2911  Aldehyde Dehydrogenase  43.3 
 
 		 458 aa  361  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4853  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.23 
 
 		 456 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.01 
 
 		 456 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11010  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  46.09 
 
 		 458 aa  360  2e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.148552  normal  0.0213171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01482  predicted aldehyde dehydrogenase  42.79 
 
 		 462 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2121  Aldehyde Dehydrogenase  42.79 
 
 		 462 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0323198  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0775  aldehyde dehydrogenase  41.61 
 
 		 463 aa  360  3e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.442992  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01493  hypothetical protein  42.79 
 
 		 462 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1681  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.79 
 
 		 462 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.956976  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1607  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.79 
 
 		 462 aa  360  4e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.764255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2133  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.79 
 
 		 462 aa  360  4e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2005  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  43.68 
 
 		 462 aa  359  5e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176912 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4876  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.01 
 
 		 456 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  42.07 
 
 		 460 aa  358  8e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0160  aldehyde dehydrogenase  44.32 
 
 		 456 aa  358  8e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0330  aldehyde dehydrogenase family protein  41.43 
 
 		 457 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0316513  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1725  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.57 
 
 		 462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.875923  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1647  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.57 
 
 		 462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0388  Aldehyde Dehydrogenase_  43.67 
 
 		 458 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000227501  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2138  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.57 
 
 		 462 aa  356  5e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.752498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1018  aldehyde dehydrogenase  41.85 
 
 		 463 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.752265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1940  aldehyde dehydrogenase  39.91 
 
 		 454 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.613178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>