24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2335 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2335  methyltransferase FkbM  100 
 
 
233 aa  478  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352701  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1267  methyltransferase FkbM family  37.39 
 
 
255 aa  155  7e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3336  hypothetical protein  31.12 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35135  predicted protein  25.19 
 
 
373 aa  63.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.256203  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0538  methyltransferase FkbM family  28.02 
 
 
228 aa  58.9  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45808  predicted protein  23.44 
 
 
784 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558065  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  24.68 
 
 
265 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13911  hypothetical protein  22.03 
 
 
264 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  25.37 
 
 
283 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0759  methyltransferase FkbM family  24.52 
 
 
444 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4762  FkbM family methyltransferase  25.49 
 
 
243 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175794  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1894  methyltransferase FkbM  29.03 
 
 
268 aa  45.4  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2942  FkbM family methyltransferase  28.57 
 
 
477 aa  45.4  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342102  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  24.88 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4250  methyltransferase FkbM  25.89 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  22.87 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00730  methyltransferase, FkbM family  26.4 
 
 
314 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.614397  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  25.16 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  30.06 
 
 
283 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1328  methyltransferase FkbM family protein  27.39 
 
 
785 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5478  methyltransferase FkbM family  26.09 
 
 
258 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1207  hypothetical protein  22.73 
 
 
250 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  24.86 
 
 
430 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  25 
 
 
569 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.909062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>