24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1161 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1161  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  435  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000308056  hitchhiker  0.00693044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1170  hypothetical protein  71.16 
 
 		 215 aa  317  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00488773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0861  hypothetical protein  76.61 
 
 		 171 aa  270  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0344  hypothetical protein  42.31 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2313  hypothetical protein  38.12 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1192  zinc-finger protein  36.24 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0985672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1827  hypothetical protein  38.31 
 
 		 204 aa  138  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0155623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1284  hypothetical protein  33.94 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.344133 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1816  hypothetical protein  37.81 
 
 		 204 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.251111  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0116  zinc-finger protein  37.38 
 
 		 221 aa  127  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0461  hypothetical protein  32.26 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000610551  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3131  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0879  zinc-finger protein  37.38 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.67931  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1152  hypothetical protein  34.7 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1635  hypothetical protein  31.86 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4335  methylenetetrahydrofolate reductase  47.14 
 
 		 538 aa  75.1  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1007  hypothetical protein  30.52 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000023113  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1782  hypothetical protein  52.83 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  hitchhiker  0.00610766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4500  methylenetetrahydrofolate reductase  59.57 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20901  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0801  methylenetetrahydrofolate reductase  59.57 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.642261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4638  methylenetetrahydrofolate reductase domain-containing protein  59.57 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4632  methylenetetrahydrofolate reductase  57.45 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.35154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0077  methylenetetrahydrofolate reductase  37.33 
 
 		 523 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.026551  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0302  hypothetical protein  31.58 
 
 		 163 aa  52.8  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>