16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0266 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0266  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  266  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.485965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0577  type IV pilus assembly PilZ  33.63 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1008  type IV pilus assembly PilZ  30.63 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.040213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3252  type IV pilus assembly PilZ  30.63 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1192  hypothetical protein  25.42 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0114728  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0228  hypothetical protein  25.42 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3298  type IV pilus assembly PilZ  25.86 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3538  type IV pilus assembly PilZ  25.62 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.95564  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0757  type IV pilus assembly PilZ  28.45 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0950  type IV pilus assembly PilZ  25.64 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622981  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00996  hypothetical protein  26.27 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0883  type IV pilus assembly PilZ  32.56 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0656  putative signaling protein  25.29 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3353  type IV pilus assembly PilZ  29.82 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0114  hypothetical protein  26.36 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0200931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3986  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  36 
 
 		 236 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.694656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>