20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3695 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010815  Glov_3695  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  636    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.483298  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2116  hypothetical protein  47.81 
 
 
322 aa  294  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1015  hypothetical protein  42.63 
 
 
322 aa  232  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0906431  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0964  hypothetical protein  31.3 
 
 
343 aa  148  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0950  hypothetical protein  32.08 
 
 
313 aa  146  5e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.785839  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0856  hypothetical protein  38.18 
 
 
321 aa  93.2  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1424  hypothetical protein  29.87 
 
 
321 aa  86.3  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0941  hypothetical protein  29.65 
 
 
192 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.421958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  22.76 
 
 
318 aa  62.4  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0686  phage integrase family protein  36.52 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1356  hypothetical protein  43.06 
 
 
76 aa  59.3  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.527083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1431  phage integrase family protein  34.11 
 
 
296 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012037  Athe_2777  hypothetical protein  28.33 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  23.91 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4432  phage integrase family protein  28.21 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.417211 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  28.33 
 
 
295 aa  46.6  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  27.49 
 
 
316 aa  46.2  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  23.86 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  23.86 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  23.86 
 
 
300 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>