12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2668 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2668  hypothetical protein  100 
 
 
494 aa  996    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3940  hypothetical protein  54.62 
 
 
488 aa  521  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1111  hypothetical protein  50.74 
 
 
484 aa  442  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.255858  hitchhiker  0.000181601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3579  hypothetical protein  49.08 
 
 
494 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0885  hypothetical protein  48.39 
 
 
482 aa  396  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1359  hypothetical protein  30.95 
 
 
209 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0327501  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3824  hypothetical protein  24.49 
 
 
231 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112724  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0110  hypothetical protein  26.63 
 
 
231 aa  53.5  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00209579  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3230  hypothetical protein  25.49 
 
 
192 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0117  hypothetical protein  26.23 
 
 
195 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3753  hypothetical protein  24.85 
 
 
224 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0227432  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1555  hypothetical protein  23.67 
 
 
220 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>