More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3974 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3974  cytochrome P450  100 
 
 
412 aa  842    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5151  cytochrome P450  69.49 
 
 
410 aa  600  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1607  cytochrome P450  68.37 
 
 
414 aa  596  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798045  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4572  cytochrome P450  66.99 
 
 
411 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4660  cytochrome P450  66.99 
 
 
411 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.026328  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4955  cytochrome P450  66.75 
 
 
411 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3970  cytochrome P450  66.83 
 
 
436 aa  561  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  58.25 
 
 
408 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2612  cytochrome P450  58.01 
 
 
408 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143454  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3821  cytochrome P450 monooxygenase  56.08 
 
 
407 aa  479  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2739  cytochrome P450 CYP125  55.17 
 
 
413 aa  463  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.251289  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13578  cytochrome P450 125 cyp125  56.44 
 
 
433 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0110795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0773  putative cytochrome P450  55.83 
 
 
416 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  0.121605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3290  cytochrome P450  55.69 
 
 
417 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121591  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1508  cytochrome P450  54.03 
 
 
420 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5258  cytochrome P450  53.32 
 
 
419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2753  putative cytochrome P450  55.45 
 
 
423 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  0.16215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2723  putative cytochrome P450  55.45 
 
 
423 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.538168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2767  putative cytochrome P450  55.45 
 
 
423 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.052524  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5062  cytochrome P450  53.81 
 
 
427 aa  438  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268876  normal  0.872733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4677  cytochrome P450  53.81 
 
 
427 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4763  cytochrome P450  53.81 
 
 
427 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3012  cytochrome P450  55.21 
 
 
419 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.839799  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  43.29 
 
 
401 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  41.83 
 
 
418 aa  322  6e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  41.6 
 
 
400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  40.55 
 
 
406 aa  292  9e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  42.6 
 
 
427 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  42.6 
 
 
427 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  42.6 
 
 
427 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  41.12 
 
 
428 aa  280  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  40.94 
 
 
406 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  41.5 
 
 
415 aa  280  5e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0813  cytochrome P450  38.92 
 
 
427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3006  linalool 8-monooxygenase  39.19 
 
 
433 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2991  linalool 8-monooxygenase  39.2 
 
 
433 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3035  linalool 8-monooxygenase  39.2 
 
 
433 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  41.07 
 
 
434 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1032  cytochrome P450  36.23 
 
 
414 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0161128  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  39.8 
 
 
433 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1908  cytochrome P450  38.67 
 
 
412 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422932  normal  0.356774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7140  cytochrome P450 CYP124E1  38.07 
 
 
428 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.946745  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  36.9 
 
 
418 aa  249  7e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2431  cytochrome P450  40.11 
 
 
424 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2640  cytochrome P450  36.71 
 
 
425 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7142  cytochrome P450 CYP124E1  38.77 
 
 
418 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2234  cytochrome P450  35.39 
 
 
417 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7141  cytochrome P450 CYP124E1  37.87 
 
 
416 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3600  cytochrome P450  35.52 
 
 
422 aa  237  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2014  cytochrome P450  35.14 
 
 
417 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1995  cytochrome P450  35.14 
 
 
417 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228695  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2060  cytochrome P450  35.14 
 
 
417 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.340582  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2694  cytochrome P450  39.13 
 
 
449 aa  236  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7659  cytochrome P450 CYP124E1  39.14 
 
 
412 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2786  cytochrome P450  36.25 
 
 
422 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00511123  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4043  cytochrome P450  38.4 
 
 
430 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  32.93 
 
 
417 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0012  cytochrome P450  36.85 
 
 
422 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  33.49 
 
 
442 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2720  cytochrome P450  35.99 
 
 
408 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7496  cytochrome P450 family protein  34.46 
 
 
415 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  37.91 
 
 
424 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  37.91 
 
 
424 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4740  cytochrome P450  37.91 
 
 
424 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59592  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1301  cytochrome P450  34.61 
 
 
420 aa  225  9e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.559778  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1010  cytochrome P450  36 
 
 
428 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1037  cytochrome P450  36 
 
 
416 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0986307  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1027  cytochrome P450  36 
 
 
416 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.810593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  38.07 
 
 
401 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0759  cytochrome P450  33.9 
 
 
403 aa  220  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7254  cytochrome P450  32.25 
 
 
431 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1929  cytochrome P450  36.86 
 
 
414 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.12886  normal  0.128389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  35.73 
 
 
420 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  31.97 
 
 
414 aa  219  7e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  34.88 
 
 
412 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5053  cytochrome P450  34 
 
 
419 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1009  cytochrome P450  34.61 
 
 
420 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1026  cytochrome P450  34.61 
 
 
420 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.60659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1036  cytochrome P450  34.35 
 
 
420 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10793  cytochrome P450 126 cyp126  36.03 
 
 
414 aa  216  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  37.15 
 
 
409 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5052  cytochrome P450  35.5 
 
 
416 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  33.5 
 
 
418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1796  cytochrome P450  34.18 
 
 
413 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.222543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1843  cytochrome P450  34.18 
 
 
413 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.491191  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1777  cytochrome P450  34.18 
 
 
413 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2021  cytochrome P450  34.02 
 
 
412 aa  213  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  33.33 
 
 
399 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  36.55 
 
 
404 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3721  cytochrome P450  32.29 
 
 
419 aa  210  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.540203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3992  hypothetical protein  35.77 
 
 
429 aa  210  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5144  cytochrome P450  34.31 
 
 
409 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623851  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  34.71 
 
 
412 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4553  cytochrome P450  36.25 
 
 
404 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.174977  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  32.34 
 
 
411 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3446  cytochrome P450  30.91 
 
 
424 aa  203  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2967  cytochrome P450  34.73 
 
 
434 aa  202  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303691 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2021  cytochrome P450  32.1 
 
 
428 aa  202  9e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1021  cytochrome P450  31.68 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0609813  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  33.09 
 
 
402 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>