18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3969 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3969  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15097  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3853  hypothetical protein  56.72 
 
 
136 aa  157  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4417  nuclear transport factor 2  37.14 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2441  hypothetical protein  31.97 
 
 
133 aa  82  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.655393  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1592  nuclear transport factor 2  34.88 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4969  nuclear transport factor 2  35.38 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1249  hypothetical protein  37.4 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.64479  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5165  nuclear transport factor 2  34.62 
 
 
143 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4586  nuclear transport factor 2  34.62 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4674  nuclear transport factor 2  34.62 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10775  hypothetical protein  32.03 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2031  putative ketosteroid isomerase  24.06 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3431  nuclear transport factor 2  33.61 
 
 
267 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3185  nuclear transport factor 2  26.77 
 
 
268 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572325  normal  0.409809 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3765  nuclear transport factor 2  31.3 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581539  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3803  hypothetical protein  29.37 
 
 
224 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12079  hypothetical protein  29.37 
 
 
265 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4985  steroid delta-5-3-ketosteroid isomerase  24.58 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>