11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3265 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3265  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
447 aa  904    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2927  hypothetical protein  36.52 
 
 
444 aa  245  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.369084  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4265  Pyrrolo-quinoline quinone  32.47 
 
 
429 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494797  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1863  hypothetical protein  34.82 
 
 
427 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1910  Pyrrolo-quinoline quinone  34.82 
 
 
427 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1844  Pyrrolo-quinoline quinone  34.59 
 
 
427 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2094  Pyrrolo-quinoline quinone  32.08 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13051  hypothetical protein  32.87 
 
 
360 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.102461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0761  Pyrrolo-quinoline quinone  28.88 
 
 
421 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4255  Pyrrolo-quinoline quinone  24.44 
 
 
630 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  52 
 
 
383 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>