12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2934 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2934  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  234  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4743  hypothetical protein  45.45 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6597  hypothetical protein  43.7 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0737  hypothetical protein  44.54 
 
 
118 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849645  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  50 
 
 
323 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4256  hypothetical protein  33.88 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0938  hypothetical protein  48.08 
 
 
224 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  51.11 
 
 
497 aa  41.6  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  47.73 
 
 
287 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1106  hypothetical protein  48.78 
 
 
172 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1120  hypothetical protein  30.21 
 
 
192 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.036635  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0337  hypothetical protein  42.86 
 
 
175 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.193382  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>