16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0375 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0375  putative bile acid 7-alpha dehydratase  100 
 
 
171 aa  350  7e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  39.16 
 
 
166 aa  107  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1548  hypothetical protein  37.24 
 
 
151 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3645  hypothetical protein  40 
 
 
167 aa  92.8  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52617  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  34.03 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  31.65 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  30.38 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  30.97 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  36.09 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  29.17 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  25.17 
 
 
163 aa  44.3  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  31.62 
 
 
164 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  27.46 
 
 
190 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7188  hypothetical protein  29.08 
 
 
147 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168742  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  31.06 
 
 
163 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0536  hypothetical protein  28.1 
 
 
181 aa  41.2  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>