110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3901 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3986  nitric oxide reductase  97.89 
 
 		 762 aa  1516    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3493  nitric-oxide reductase subunit B  45.47 
 
 		 756 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3178  cytochrome c oxidase, subunit I  51.46 
 
 		 769 aa  724    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1569  nitric-oxide reductase subunit B  52.17 
 
 		 783 aa  738    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1593  nitric-oxide reductase subunit B  52.17 
 
 		 783 aa  738    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.718907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1539  nitric-oxide reductase subunit B  52.17 
 
 		 783 aa  737    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0778717  normal  0.182091 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3302  cytochrome c oxidase subunit I  50.93 
 
 		 769 aa  718    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3901  nitric oxide reductase  100 
 
 		 763 aa  1547    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28590  nitric oxide reductase large subunit  50.68 
 
 		 840 aa  737    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0364  putative nitric-oxide reductase  42.27 
 
 		 761 aa  586  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.596317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3167  nitric oxide reductase large subunit  40.84 
 
 		 759 aa  522  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1575  nitric oxide reductase large subunit-like protein  37.97 
 
 		 747 aa  518  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.362479  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5055  nitric oxide reductase large subunit  41.88 
 
 		 761 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5786  putative nitric-oxide reductase  39.95 
 
 		 748 aa  513  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2413  nitric oxide reductase large subunit-like protein  36.59 
 
 		 744 aa  507  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1556  Nitric-oxide reductase  38.05 
 
 		 787 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4614  nitric oxide reductase large subunit-like protein  38.96 
 
 		 756 aa  504  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0294129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3848  putative nitric-oxide reductase  38.13 
 
 		 764 aa  505  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3044  putative nitric-oxide reductase  37.3 
 
 		 767 aa  505  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0283046  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1520  nitric oxide reductase large subunit-like protein  38.75 
 
 		 759 aa  498  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2427  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  38.39 
 
 		 760 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376989  normal  0.0606643 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3720  putative nitric-oxide reductase  38.21 
 
 		 763 aa  495  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1403  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  38.13 
 
 		 762 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2932  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  39.66 
 
 		 758 aa  490  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3860  putative nitric-oxide reductase  37.62 
 
 		 763 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2454  Nitric-oxide reductase  37.83 
 
 		 762 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3777  putative nitric-oxide reductase  37.48 
 
 		 763 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2550  Nitric-oxide reductase  37.83 
 
 		 762 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0092  nitric oxide reductase large subunit  38.38 
 
 		 768 aa  484  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5200  putative nitric-oxide reductase  39.17 
 
 		 759 aa  485  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1886  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  36.09 
 
 		 774 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.549949  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1328  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  35.77 
 
 		 758 aa  481  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126926  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1535  arginyl-tRNA synthetase (arginine--tRNA ligase; ArgRS)  37 
 
 		 743 aa  479  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0453039  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0761  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  38.02 
 
 		 762 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3072  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  38.29 
 
 		 761 aa  478  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.493365  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0728  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  37.99 
 
 		 758 aa  476  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0657  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  39.46 
 
 		 763 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1004  putative nitric-oxide reductase  36.86 
 
 		 769 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.138313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0109  nitric oxide reductase large subunit  39.03 
 
 		 768 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.229583  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0633  nitric oxide reductase norZ, putative  36.02 
 
 		 762 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2802  nitric oxide reductase, subunit B  36.02 
 
 		 762 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3253  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  37.5 
 
 		 762 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2379  putative nitric oxide reductase norZ  36.02 
 
 		 762 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2908  putative nitric oxide reductase norZ  36.02 
 
 		 762 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2680  hypothetical protein  35.89 
 
 		 762 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2738  hypothetical protein  36.02 
 
 		 762 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1694  putative nitric oxide reductase norZ  36.02 
 
 		 762 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.732748  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1608  hypothetical protein  37.99 
 
 		 746 aa  469  9.999999999999999e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4013  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  35.87 
 
 		 758 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.23875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4126  nitric oxide reductase subunit B  35.87 
 
 		 758 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1505  nitric oxide reductase subunit B  36.33 
 
 		 756 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0794416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3089  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  37.55 
 
 		 761 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0963858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1813  nitric oxide reductase  35.42 
 
 		 762 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0883  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  37.68 
 
 		 761 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0356599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0846  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  38.16 
 
 		 761 aa  458  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00975115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3822  putative nitric oxide reductase (subunit B) transmembrane protein  38.29 
 
 		 761 aa  459  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0625212  hitchhiker  0.000200151 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1980  Nitric-oxide reductase  36.23 
 
 		 762 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.187337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1902  cytochrome b subunit of nitric oxide reductase  34 
 
 		 763 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.960689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0182  Nitric-oxide reductase  33.99 
 
 		 776 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0873  Nitric-oxide reductase  32.93 
 
 		 1077 aa  425  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2162  hypothetical protein  34.41 
 
 		 780 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2189  hypothetical protein  34.28 
 
 		 780 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0945  nitric oxide reductase  34.27 
 
 		 773 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33419  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2060  nitric oxide reductase  33.87 
 
 		 773 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0799  nitric oxide reductase  33.2 
 
 		 772 aa  356  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0547  nitric oxide reductase  33.2 
 
 		 772 aa  356  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0658  nitric oxide reductase  33.2 
 
 		 772 aa  356  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.971693  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0472  Nitric-oxide reductase  31.27 
 
 		 739 aa  325  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000690238  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0474  nitric oxide reductase  33.76 
 
 		 683 aa  283  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0351  Nitric-oxide reductase  29.33 
 
 		 748 aa  264  4.999999999999999e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000483731  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1965  nitric oxide reductase large subunit  35.55 
 
 		 518 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.575096  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1908  nitric oxide reductase, cytochrome b subunit  27.84 
 
 		 720 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0502  nitric oxide reductase, cytochrome b subunit  26.68 
 
 		 734 aa  208  3e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.309597 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2401  nitric oxide reductase large subunit-like protein protein  27.7 
 
 		 706 aa  191  5e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0286  nitric oxide reductase, cytochrome b subunit  26.77 
 
 		 731 aa  187  6e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00622687 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0561  nitric-oxide reductase subunit B  31.42 
 
 		 467 aa  128  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000153922  normal  0.745832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2758  nitric-oxide reductase  28.3 
 
 		 452 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2400  nitric-oxide reductase, B subunit, putative  29.64 
 
 		 481 aa  120  9e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3191  cytochrome c oxidase, subunit I  30.18 
 
 		 458 aa  120  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2598  Nitric-oxide reductase  29.26 
 
 		 460 aa  119  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605151  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0601  nitric-oxide reductase, B subunit  29.17 
 
 		 463 aa  117  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3115  cytochrome c oxidase, subunit I  28.35 
 
 		 471 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.86762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1248  cytochrome c oxidase subunit I  25 
 
 		 457 aa  114  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.883725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3034  Nitric-oxide reductase  24.33 
 
 		 457 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1984  nitric-oxide reductase subunit NorB  27.08 
 
 		 474 aa  112  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000788431  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1468  cytochrome c oxidase subunit I  26.88 
 
 		 483 aa  110  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0625  nitric-oxide reductase subunit B  27.17 
 
 		 465 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06830  nitric-oxide reductase subunit B  27.57 
 
 		 465 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2483  cytochrome c oxidase, subunit I  27.12 
 
 		 462 aa  107  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  29.86 
 
 		 460 aa  107  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3184  nitric oxide reductase subunit B  25.87 
 
 		 459 aa  105  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.500001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1642  Nitric-oxide reductase  26.81 
 
 		 448 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0323  nitric oxide reductase large subunit, cytochrome b  27.22 
 
 		 446 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558101  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1980  cytochrome c oxidase, subunit I  29.97 
 
 		 471 aa  102  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1968  cytochrome c oxidase, subunit I  27.13 
 
 		 446 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2089  nitric-oxide reductase subunit B  26.2 
 
 		 448 aa  100  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6288  nitric-oxide reductase  27.48 
 
 		 448 aa  100  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4387  nitric-oxide reductase  24.84 
 
 		 448 aa  99  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0971  nitric-oxide reductase  27.39 
 
 		 446 aa  98.2  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.838471  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0249  nitric-oxide reductase, large subunit  24.55 
 
 		 449 aa  96.3  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>