14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2963 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2963  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 140 aa  289  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1262  rhodanese domain protein  93.57 
 
 		 141 aa  276  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2518  hypothetical protein  58.26 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.956557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1977  Rhodanese domain protein  44.78 
 
 		 138 aa  130  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.474064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3866  Rhodanese domain protein  32.76 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.138224  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  24.62 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  27.1 
 
 		 221 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  27.1 
 
 		 221 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  27.1 
 
 		 221 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  33.71 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  24.43 
 
 		 711 aa  42  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  26.87 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  26.47 
 
 		 194 aa  40  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>