12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1581 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1581  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  338  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2632  hypothetical protein  92.17 
 
 		 166 aa  319  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.797244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4583  hypothetical protein  45.62 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.254207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6554  hypothetical protein  45.39 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.999117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4966  hypothetical protein  43.51 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.104499  normal  0.177595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0174  hypothetical protein  45.1 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2354  hypothetical protein  41.51 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0296  hypothetical protein  41.03 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3071  hypothetical protein  23.31 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0683  hypothetical protein  28.67 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1175  hypothetical protein  28.22 
 
 		 168 aa  47.8  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1351  hypothetical protein  23.38 
 
 		 181 aa  41.2  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>