15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1364 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1364  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  226  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2920  hypothetical protein  95.61 
 
 		 114 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4341  hypothetical protein  37.72 
 
 		 115 aa  88.2  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2893  hypothetical protein  38.64 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000100997  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1167  hypothetical protein  38.1 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2402  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000157501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1722  hypothetical protein  31.4 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2513  hypothetical protein  34.44 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00274394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1706  hypothetical protein  34.44 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0633e-25 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  31.4 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2896  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.63466e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000365631  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  33.94 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2780  hypothetical protein  28.28 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000634208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4508  hypothetical protein  37.1 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.322644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>