38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1246 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1246  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1018  hypothetical protein  78.3 
 
 		 106 aa  168  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1439  hypothetical protein  74.03 
 
 		 81 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.766966  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  60.76 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0568  hypothetical protein  57.89 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2376  hypothetical protein  44.74 
 
 		 80 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2500  hypothetical protein  41.89 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00388461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3956  hypothetical protein  43.48 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  41.18 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  35.53 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1650  hypothetical protein  35.35 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1329  Protein of unknown function DUF2442  40.28 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  40.58 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0492  hypothetical protein  36 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0903  hypothetical protein  36.23 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.50164  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1569  hypothetical protein  40.28 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.997179  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  36.71 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  35.21 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1900  hypothetical protein  40.98 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.030985 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2658  hypothetical protein  35.71 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0823788  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1211  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  37.18 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0265  hypothetical protein  32.86 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0192  hypothetical protein  30.56 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.77367  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2429  hypothetical protein  32.5 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1342  hypothetical protein  43.08 
 
 		 80 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1387  hypothetical protein  43.08 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3398  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  31.65 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3487  hypothetical protein  32.47 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.106704 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1066  hypothetical protein  30.68 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1403  hypothetical protein  35.48 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1142  hypothetical protein  30.59 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1285  hypothetical protein  35.48 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0617  hypothetical protein  40.3 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0622  hypothetical protein  35.71 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000178223  unclonable  0.0000000000835363 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00619  hypothetical protein  36.67 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1449  hypothetical protein  28.77 
 
 		 90 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  36.99 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1097  hypothetical protein  40.38 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>