40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2056 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2056  DoxX family protein  100 
 
 
170 aa  344  4e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.991366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2976  DoxX family protein  74.27 
 
 
171 aa  261  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3072  DoxX family protein  50 
 
 
166 aa  184  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4469  hypothetical protein  51.63 
 
 
166 aa  179  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000117454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4431  hypothetical protein  52.67 
 
 
166 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0296378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4482  hypothetical protein  52.67 
 
 
166 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4197  DoxX family protein  50.3 
 
 
166 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0768  hypothetical protein  52.29 
 
 
166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123691  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4247  hypothetical protein  52.67 
 
 
166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000990049  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4578  hypothetical protein  52.67 
 
 
166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.413157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4430  hypothetical protein  52.67 
 
 
166 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4085  hypothetical protein  52.67 
 
 
166 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.62393e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4096  hypothetical protein  51.33 
 
 
166 aa  175  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000575667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0160  hypothetical protein  58.11 
 
 
168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0167  hypothetical protein  58.11 
 
 
168 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0169  hypothetical protein  58.11 
 
 
168 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0195  hypothetical protein  57.43 
 
 
168 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0162  hypothetical protein  58.11 
 
 
168 aa  160  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0189  hypothetical protein  57.43 
 
 
168 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0154  DoxX family protein  54.09 
 
 
168 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5130  hypothetical protein  56.76 
 
 
168 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0211  hypothetical protein  56.76 
 
 
168 aa  157  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2557  DoxX family protein  45.12 
 
 
253 aa  140  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2566  DoxX family protein  43.31 
 
 
197 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3069  DoxX  44.94 
 
 
196 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.755754  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0699  TQO small subunit DoxD  40.51 
 
 
187 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1362  DoxX family protein  38.12 
 
 
191 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0024  hypothetical protein  36.08 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000226699  hitchhiker  0.00000131206 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14860  NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit  29.17 
 
 
593 aa  72  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846924  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0366  hypothetical protein  25 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.678481  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0083  DoxX family protein  33.11 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0560  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.87 
 
 
591 aa  55.1  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0953  DoxX family protein  33.33 
 
 
185 aa  54.7  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.661535  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1140  hypothetical protein  37.5 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.325638  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0082  TQO small subunit DoxD  30.43 
 
 
164 aa  48.5  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000522418  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3491  DoxX family protein  27.38 
 
 
177 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0747  DoxX family protein  22.52 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0731  DoxX family protein  22.52 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1418  DoxX family protein  30.25 
 
 
167 aa  42  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.385267  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1170  DoxX family protein  31.03 
 
 
166 aa  41.6  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0468512  normal  0.232556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>