26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1140 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1140  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  323  8.000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.325638  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1433  DoxX family protein  63.92 
 
 
166 aa  223  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1170  DoxX family protein  62.89 
 
 
166 aa  214  5.9999999999999996e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0468512  normal  0.232556 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1418  DoxX family protein  63.75 
 
 
167 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.385267  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1211  DoxX family protein  60.9 
 
 
157 aa  201  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1543  DoxX family protein  63.12 
 
 
166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700988  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0934  hypothetical protein  56.13 
 
 
166 aa  189  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0501  DoxX family protein  44.29 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0030496  decreased coverage  0.000000426617 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3069  DoxX  33.66 
 
 
196 aa  51.6  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.755754  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2056  DoxX family protein  37.5 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.991366  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0699  TQO small subunit DoxD  29 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4469  hypothetical protein  26.43 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000117454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0768  hypothetical protein  26.43 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123691  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2976  DoxX family protein  30 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4197  DoxX family protein  26.43 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3072  DoxX family protein  25.53 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4578  hypothetical protein  26.15 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.413157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4096  hypothetical protein  26.15 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000575667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4430  hypothetical protein  26.15 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4085  hypothetical protein  26.15 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.62393e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14860  NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit  23.24 
 
 
593 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4247  hypothetical protein  26.15 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000990049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4482  hypothetical protein  26.15 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4431  hypothetical protein  26.15 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0296378  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2566  DoxX family protein  27.97 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2557  DoxX family protein  26.42 
 
 
253 aa  41.2  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>