20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0082 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0082  TQO small subunit DoxD  100 
 
 
164 aa  315  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000522418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0560  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.7 
 
 
591 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0699  TQO small subunit DoxD  32.8 
 
 
187 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3069  DoxX  35.11 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.755754  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2557  DoxX family protein  29.56 
 
 
253 aa  48.5  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2056  DoxX family protein  30.43 
 
 
170 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.991366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14860  NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit  31.82 
 
 
593 aa  47.8  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846924  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2566  DoxX family protein  30.43 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2732  hypothetical protein  29.73 
 
 
218 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0444873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4096  hypothetical protein  27.27 
 
 
166 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000575667  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1027  DoxX family protein  29.49 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.662698 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3072  DoxX family protein  25 
 
 
166 aa  41.2  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1362  DoxX family protein  27.45 
 
 
191 aa  41.2  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4482  hypothetical protein  26.26 
 
 
166 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4431  hypothetical protein  26.26 
 
 
166 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0296378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4430  hypothetical protein  26.26 
 
 
166 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2976  DoxX family protein  29.01 
 
 
171 aa  40.8  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4578  hypothetical protein  26.26 
 
 
166 aa  40.8  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.413157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4085  hypothetical protein  26.26 
 
 
166 aa  40.8  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.62393e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4247  hypothetical protein  26.26 
 
 
166 aa  40.8  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000990049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>