39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0076 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1960  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1314 bp  2605    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1671  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1314 bp  2605    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1431  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1314 bp  2605    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1405  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1314 bp  2605    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000656781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0492  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1314 bp  2605    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0491    99.94 
 
 
3550 bp  3205    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0077  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1314 bp  2605    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0076    100 
 
 
2632 bp  5218    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0069  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1314 bp  2605    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0068    100 
 
 
3046 bp  3213    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.203635  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1849  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1314 bp  2605    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.598163  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1940  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1314 bp  2605    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.267647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2091  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1314 bp  2605    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00414854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2470  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1314 bp  2605    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2726    100 
 
 
2322 bp  1376    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.936477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2778  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1314 bp  2605    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0956376  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2817    100 
 
 
5864 bp  1822    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2890  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1314 bp  2605    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3080  transposase IS4 family protein  99.92 
 
 
1314 bp  2597    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3168  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1314 bp  2605    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3193  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1314 bp  2605    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3271  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1314 bp  2605    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3323  transposase IS4 family protein  100 
 
 
1314 bp  2605    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000471748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0074  TIM-barrel protein, nifR3 family  81.26 
 
 
1002 bp  402  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0071  NifR3 family TIM-barrel protein  78.96 
 
 
999 bp  216  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0084  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  78.81 
 
 
999 bp  208  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000319456 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0087  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  79.17 
 
 
999 bp  208  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.811614  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0071  NifR3 family TIM-barrel protein  78.81 
 
 
999 bp  208  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5233  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  79.39 
 
 
999 bp  204  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.471264  hitchhiker  0.000000472201 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0071  nifR3 family TIM-barrel protein  78.59 
 
 
999 bp  202  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0075  NifR3 family TIM-barrel protein  78.66 
 
 
975 bp  200  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0075  NifR3 family TIM-barrel protein  78.66 
 
 
975 bp  200  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0071  nifR3 family TIM-barrel protein  79.05 
 
 
999 bp  188  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0074  NifR3 family TIM-barrel protein  79.22 
 
 
999 bp  180  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0083  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  79.63 
 
 
999 bp  176  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2783  putative dihydrouridine synthase  83.33 
 
 
981 bp  56  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2221  tRNA-dihydrouridine synthase  96.77 
 
 
1005 bp  54  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0425  NifR3 family TIM-barrel protein  94.12 
 
 
975 bp  52  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0176336  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0279  tRNA-dihydrouridine synthase  90.24 
 
 
1008 bp  50.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.690235  hitchhiker  0.007193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>