17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0698 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0698  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 753 aa  1481    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2816  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.29 
 
 		 720 aa  566  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1178  PBS HEAT-like repeat-containing protein  31.12 
 
 		 719 aa  343  7e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2040  PBS lyase heat-like repeat protein  31.11 
 
 		 742 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0286  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.59 
 
 		 545 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4094  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.72 
 
 		 522 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0423  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.48 
 
 		 534 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0642387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0756  HEAT repeat-containing protein  26.05 
 
 		 541 aa  66.6  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000382478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3999  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.78 
 
 		 522 aa  64.3  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00751292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3276  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.36 
 
 		 557 aa  58.9  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257764  normal  0.485312 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0131  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.65 
 
 		 547 aa  58.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000220266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0250  hypothetical protein  27.64 
 
 		 559 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0538919  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0234  hypothetical protein  26.02 
 
 		 564 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  24.11 
 
 		 395 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.11 
 
 		 395 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  31.82 
 
 		 493 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  24.12 
 
 		 959 aa  44.3  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>