29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1759 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1759  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 		 378 aa  766    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123674 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2458  glycosyltransferase-like protein  93.39 
 
 		 378 aa  717    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2856  glycosyltransferase-like protein  59.31 
 
 		 376 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2035  glycosyltransferase  56.51 
 
 		 390 aa  401  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1530  glycosyl transferase, group 1  43.77 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2289  glycosyl transferase group 1  43.16 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582583 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1403  glycosyl transferase group 1  40.36 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0984  glycosyl transferase group 1  39.73 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1696  glycosyl transferase group 1  39.73 
 
 		 366 aa  236  6e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3631  glycosyl transferase, group 1  37.17 
 
 		 363 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2123  glycosyl transferase, group 1  40.06 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.887263  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0516  glycosyl transferase group 1  37.35 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.869562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2466  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2229  hypothetical protein  31.82 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1606  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.444102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  25.36 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  22.58 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 		 368 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2778  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2748  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2792  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.36 
 
 		 398 aa  46.2  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.36 
 
 		 398 aa  46.2  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3285  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  27.95 
 
 		 417 aa  42.7  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>