17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1694 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1694  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  244  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.003139 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  36.94 
 
 		 644 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  36.94 
 
 		 782 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4946  hypothetical protein  30.7 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0430991  normal  0.401264 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1894  Rhs element Vgr protein  31.97 
 
 		 763 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  36.04 
 
 		 782 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  30.33 
 
 		 763 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  30.33 
 
 		 763 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  30.33 
 
 		 763 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1591  hypothetical protein  28.24 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00589493  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1534  hypothetical protein  45.76 
 
 		 1017 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  31.86 
 
 		 748 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  31.86 
 
 		 748 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  31.86 
 
 		 748 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  31.86 
 
 		 748 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1898  hypothetical protein  29.36 
 
 		 284 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5706  hypothetical protein  31.34 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.989456  normal  0.293458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>