20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5501 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1050  hypothetical protein  63.7 
 
 		 1608 aa  1966    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5501  hypothetical protein  100 
 
 		 1672 aa  3252    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627379  normal  0.180231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5301  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1312 aa  240  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.38 
 
 		 1506 aa  188  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1165  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1322 aa  188  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3992  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.64 
 
 		 1430 aa  176  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.589643  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0207  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.25 
 
 		 1435 aa  164  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.608322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4462  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1435 aa  155  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.8881  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2467  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1403 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2998  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1342 aa  138  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0440986  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0189  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1435 aa  136  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335759  normal  0.93166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0805  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  24.12 
 
 		 1371 aa  136  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1471  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1345 aa  129  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.984073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10238  transmembrane protein  28.53 
 
 		 1400 aa  127  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0216  putative transmembrane protein  26.95 
 
 		 1384 aa  121  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0236  putative transmembrane protein  26.67 
 
 		 1384 aa  120  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.635467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0226  putative transmembrane protein  26.67 
 
 		 1384 aa  120  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0418  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.65 
 
 		 1404 aa  114  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0253  putative transmembrane protein  29.24 
 
 		 1408 aa  97.8  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640181  normal  0.103172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0418  putative transmembrane protein  22.86 
 
 		 1347 aa  62.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280672  normal  0.0494361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>