18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3673 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3673  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  623  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0503  hypothetical protein  27.71 
 
 
332 aa  126  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2049  hypothetical protein  30.79 
 
 
308 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0530  hypothetical protein  26.9 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0126661 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3437  hypothetical protein  26.67 
 
 
330 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2347  hypothetical protein  28.12 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000400982  hitchhiker  0.00448876 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0856  hypothetical protein  28.57 
 
 
352 aa  90.9  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6230  hypothetical protein  25.61 
 
 
320 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3398  hypothetical protein  27.72 
 
 
371 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.362896  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2009  hypothetical protein  27.17 
 
 
377 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0128163  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13190  hypothetical protein  39.56 
 
 
374 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.269746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1820  hypothetical protein  37.36 
 
 
371 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.153192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 
661 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4605  hypothetical protein  36.67 
 
 
381 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1868  hypothetical protein  37.78 
 
 
371 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139738  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  24.56 
 
 
678 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4498  hypothetical protein  36.67 
 
 
371 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2219  hypothetical protein  35.56 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>