14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3347 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3347  band 7 protein  100 
 
 		 539 aa  1091    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.953991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2133  band 7 protein  28.29 
 
 		 647 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2967  hypothetical protein  28.12 
 
 		 689 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0317  band 7 protein  26.4 
 
 		 646 aa  159  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1605  band 7 protein  26.2 
 
 		 691 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.608323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5247  band 7 protein  26.2 
 
 		 691 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1093  band 7 protein  27.45 
 
 		 650 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.807858  normal  0.192088 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  25.39 
 
 		 1204 aa  127  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0142  band 7 protein  35.02 
 
 		 673 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5721  band 7 protein  25.3 
 
 		 681 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0977085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0083  Band 7 protein  26.38 
 
 		 830 aa  100  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.148744  hitchhiker  0.00195276 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7328  band 7 protein  33.63 
 
 		 660 aa  90.9  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081025 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2023  band 7 protein  30.04 
 
 		 658 aa  87.8  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7215  hypothetical protein  23.43 
 
 		 659 aa  74.7  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>