28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4150 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4150  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  437  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4711  protein of unknown function DUF1205  34.31 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.890895 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2033  hypothetical protein  34.09 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0492847  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1369  glycosyl transferase  31.97 
 
 		 374 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4707  protein of unknown function DUF1205  35.51 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3071  hypothetical protein  30.89 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2968  hypothetical protein  31.2 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610556 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2949  glycosyltransferase  30.89 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.63295e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2915  IroB  30.89 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2885  IroB  30.89 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4716  protein of unknown function DUF1205  33.99 
 
 		 424 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4727  protein of unknown function DUF1205  33.56 
 
 		 416 aa  58.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4185  IroB  38.4 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0479104  normal  0.936172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4726  protein of unknown function DUF1205  30.23 
 
 		 418 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2933  hypothetical protein  32.59 
 
 		 472 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697027  normal  0.639426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2790  protein of unknown function DUF1205  25.71 
 
 		 380 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0162419  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4715  protein of unknown function DUF1205  32.35 
 
 		 419 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3487  protein of unknown function DUF1205  32.35 
 
 		 417 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4699  protein of unknown function DUF1205  33.33 
 
 		 417 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.363631  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4360  glycosyl transferase family 28  32.47 
 
 		 443 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000448703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2112  hypothetical protein  34.81 
 
 		 467 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0819565  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4700  protein of unknown function DUF1205  30.43 
 
 		 424 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.337723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2418  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 		 397 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1263  hypothetical protein  29.1 
 
 		 387 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1886  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 403 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2776  protein of unknown function DUF1205  29.55 
 
 		 380 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00637482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2497  glycosyltransferase, MGT family  35.2 
 
 		 380 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0930  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 396 aa  41.6  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>