27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3433 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3433  NUDIX hydrolase  100 
 
 
300 aa  587  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2430  tellurite resistance TerB  53.99 
 
 
332 aa  312  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5626  putative tellurium resistance protein  35.57 
 
 
358 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1940  tellurite resistance TerB  44.3 
 
 
151 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3009  tellurite resistance TerB  43.67 
 
 
151 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380489  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3017  Tellurite resistance TerB  40.58 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000389942  decreased coverage  0.0000328621 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3770  Tellurite resistance TerB  39.26 
 
 
152 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1272  tellurite resistance TerB  38.89 
 
 
151 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0272  tellurite resistance TerB  36.72 
 
 
149 aa  89.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1001  tellurite resistance TerB  35.94 
 
 
150 aa  86.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.110378  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0810  tellurite resistance TerB  35.77 
 
 
149 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304003  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0942  tellurium resistance protein TerB  35.04 
 
 
149 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09850  Tellurite resistance TerB  35.66 
 
 
149 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0891  tellurite resistance TerB  32.03 
 
 
150 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2431  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 
148 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960036  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3787  tellurite resistance protein  25.85 
 
 
151 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000180248  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0664  tellurite resistance protein  25.85 
 
 
151 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000717053  normal  0.35704 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3875  tellurite resistance TerB  25.85 
 
 
151 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000149484  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3696  Tellurite resistance TerB  25.83 
 
 
151 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0390345  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3983  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
161 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189936  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1352  TerB  25.98 
 
 
151 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000857143  normal  0.570611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5627  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 
156 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0133288  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0058  tellurite resistance protein-like  30.87 
 
 
155 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2191  TerB  31.45 
 
 
143 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122753  hitchhiker  0.000000525485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  32.58 
 
 
143 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  30.95 
 
 
148 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 
148 aa  42.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>