22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3312 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3312  hypothetical protein  100 
 
 		 750 aa  1512    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224991  normal  0.22315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1125  hypothetical protein  48.47 
 
 		 346 aa  261  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0054  putative O-methyltransferase  41.53 
 
 		 322 aa  242  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4649  hypothetical protein  40.65 
 
 		 330 aa  231  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2031  putative O-methyltransferase  42.26 
 
 		 281 aa  189  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0606  hypothetical protein  33.87 
 
 		 374 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2030  hypothetical protein  37.33 
 
 		 383 aa  168  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1823  putative O-methyltransferase  43.4 
 
 		 283 aa  169  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.509784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3939  hypothetical protein  33.8 
 
 		 369 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0328019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1336  hypothetical protein  33.06 
 
 		 365 aa  158  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1334  hypothetical protein  39.1 
 
 		 276 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.368124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4466  putative O-methyltransferase  38.75 
 
 		 260 aa  153  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1824  hypothetical protein  33.24 
 
 		 377 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.985674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3996  hypothetical protein  39.25 
 
 		 265 aa  143  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0604  putative O-methyltransferase  38.4 
 
 		 289 aa  131  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1841  hypothetical protein  32.54 
 
 		 309 aa  127  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.447745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6753  hypothetical protein  36.25 
 
 		 255 aa  124  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4772  hypothetical protein  32.27 
 
 		 371 aa  124  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0136804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3938  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  37.04 
 
 		 693 aa  124  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.791097  normal  0.0454105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0053  hypothetical protein  28.76 
 
 		 372 aa  112  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0204  putative O-methyltransferase  39.26 
 
 		 145 aa  91.7  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.650886  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  29.17 
 
 		 1148 aa  58.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>